1. Aceh Raflesia I/II Serbejadi - 300 ha - Nangroe Aceh Darussalam
2. Arcadomas - 2 ha - Jawa Barat
3. Arjuna-Lalijiwo - 4.960 ha - Jawa Timur
4. Baringin Sati - 0,20 ha - Sumatera Barat
5. Batang Lupuh - 340 ha - Sumatera Barat
6. Batu Gajah - 1 ha - Sumatera Utara
7. Batu Gimrit - 0,50 ha - Sumatera Utara
8. Batu Kahu -1.762,80 ha - Bali
9. Besowo Gadungan - 7 ha - Jawa Timur
10. Bojong Larang - 750 ha - Jawa Barat
11. Bukit Raya -150.000 ha - Kalimantan Tengah
12. Bukit Tangkilang - 3.000 ha - Kalimantan Tengah
13. Bantimurung -18 ha - Sulawesi Selatan
14. Cadas Malang - 21 ha - Jawa Barat
15. Cigenteng Cipanyi I/II -10 ha - Jawa Barat
16. Cimangkat - 56 ha - Jawa Barat
17. Corah Manis Sempolan I/VII -16 ha - Jawa Timur
18. Curug Bengkawa -1,5 ha - Jawa Tengah
19. Digul Iwul - 9 ha - Jawa Tengah
20. Depok - 6 ha - Jawa Barat
21. Dolok Laut - 39 ha - Sumatera Utara
22. Dolok Sungap - 23.800 ha - Sumatera Utara
23. Dolok Tinggi -167 ha - Sumatera Utara
24. Dusun Besar -11,65 ha - Bengkulu
25. Geding - 2 ha - Jawa Timur
26. Gua Nglirip - 3 ha - Jawa Timur
27. Gunung Abang - 50 ha - Jawa Timur
28. Gunung Barung -195,5 ha - Jawa Timur
29. Gunung Gede -1.040 ha - Jawa Barat
30. Gunung Indrapura -15.530 ha - Sumatera Barat
31. Gunung Krakatau - 2500 ha - Lampung
32. Gunung Lokon -100 ha - Sulawesi Utara
33. Gunung Lorentz - 320.000 ha - Papua
34. Gunung Malabar - 8,3 ha - Jawa Barat
35. Gunung Palung - 3.000 ha - Kalimantan Barat
36. Gunung Papandayan -126 ha - Jawa Barat
37. Gunung Picis - 27,9 ha - Jawa Timur
38. Gunung Tangkuban Parahu -1.290 ha - Jawa Barat
39. Janggangan Rogojampi I/I - 8,5 ha - Jawa Timur
40. Karang Bolong - 0,5 ha - Jawa Tengah
41. Kawah Ijen - 2.560 ha - Jawa Timur
42. Kelìng I/II - 60 ha - Jawa Tengah
43. Kota Waringin/Sampit (Tanjung Puting) - 30.000 ha - Kalimantan Tengah
44. Laut Debuk-debuk - 7 ha - Sumatera Utara
45. Laut Pasir Tengger - 5.290 ha - Jawa Timur
46. Lembah Anai - 221 ha - Sumatera Barat
47. Lembah Harau - 298 ha - Sumatera Barat
48. Leuwang Sancang - 2.157 ha - Jawa Barat
49. Liang Balik - 0,50 ha - Sumatera Utara
50. Lopatfunpi - 8 ha - Kalimantan Barat
51. Mandor - 2.000 ha - Kalimantan Barat
52. Manggis Gadungan - 12 ha - Jawa Timur
53. Mega Mendung -12,5 ha - Sumatera Barat
54. Moga - 1 ha - Jawa Tengah
55. Muara Angke -15 ha - DKI Jakarta
56. Nusa Barong - 6.100 ha - Jawa Timur
57. Nusa Kambangan -1 ha - Jawa Tengah
58. Padang Lauwi -1.000 ha - Kalimantan Selatan
59. Panaitan -17.500 ha - Banten
60. Penanjung Pangandaran - 457 ha - Jawa Barat
61. Pancuran Ijen I/II - 9 ha - Jawa Timur
62. Panua -1500 ha - Sulawesi Utara
63. Panjalu -16 ha - Jawa Barat
64. Parawen - 6200 ha - Kalimantan Tengah
65. Penger Wunung Darupono - 30 ha - Jawa Tengah
66. Pulau Bokor -15 ha - DKI Jakarta
67. Pulau Noko dan Pulau Nusa -15 ha - Jawa Timur
68. Pulau Rambut -18 ha - DKI Jakarta
69. Pulau Seno -1.250 ha - Maluku
70. Pulau Sempu - 877 ha - Jawa Timur
71. Raflesia Bengkulu - 2.143 ha - Bengkulu
72. Raflesia Cawang - 0,22 ha - Bengkulu
73. Raflesia Despasah I/II - 0,26 ha - Bengkulu
74. Ranca Danau - 2.500 ha - Jawa Barat
75. Ranu Darungan - 380 ha - Jawa Timur
76. Ranu Kumbolo -1.340 ha - Jawa Timur
77. Ranu Paniregulo - 96 ha - Jawa Timur
78. Rimbopanti - 3.500 ha - Sumatera Barat
79. Rumphius - 2,5 ha - Maluku
80. Sangeh -10 ha - Bali
81. Saobi/Kangean - 430 ha - Jawa Timur
82. Sibolangit -115 ha - Sumatera Utara
83. Sukawayana - 79.100 ha - Banten
84. Sungai Kolbu - 9 ha - Jawa Timur
85. Takokak - 50 ha - Jawa Barat
86. Taman Baru Maelang - 70.000 ha - Jawa Timur
87. Tanah Pandauh - 500 ha - Nusa Tenggara Barat
88. Takoko Batuangus - 4.446 ha - Sulawesi Utara
89. Pelabuhan Ratu - 33 ha - Jawa Barat
90. Tanjung Amolenggo - 850 ha - Sulawesi Utara
91. Talaga Bodas - 265 ha - Jawa Barat
92. Talaga Patengan -150 ha - Jawa Barat
93. Talaga Warna - 23,25 ha - Jawa Barat
94. Telogo Dringo - 26,10 ha - Jawa Tengah
95. Telogo Ranjang -18,5 ha - Jawa Tengah
96. Telogo Sumurup - 20,10 ha - Jawa Tengah
97. Telogo warno/Pengilon - 39,6 ha - Jawa Tengah
98. Tonggala -125 ha - Sulawesi Utara
99. Ulolanan Kecubung - 71 ha - Jawa Tengah
100. Ulu Tiangko -1 ha - Jambi
101. Ujung Honye -10.000 ha - Jawa Barat
102. W. Mual -17.500 ha - Maluku
103. W. Nua - 20.000 ha - Maluku
104. Watanganan Puger I/II -16 ha - Jawa Timur
105. Wijayakusuma -1 ha - Jawa Tengah
106. Yanlapa - 32 ha - Jawa Barat
107. Yunghun - 2,5 ha - Jawa Barat.
